士孙瑞意在提示王允可借天时天时人和之机撤除董卓。王允同意士孙瑞的定见，但是考虑到董卓平时防备森严，并且他本人武力过人，如果不采纳周到办法，恐怕不易到手。因而，王允便物色了董卓的亲信吕布作内应。
在统统筹办伏贴，恰好逢上天子大病初愈，朝中文武大臣都集会于未央殿，恭贺天子龙体病愈。吕布借此机遇，事前安排同郡骑都尉李肃等人带领十多名亲兵，换上卫士的装束埋没在宫殿侧门的两边。董卓刚到侧门，便遭到李肃等人的突袭。董卓大骇，仓猝向吕布呼救。吕布正襟端坐，大声道：“我们是奏诏讨杀乱臣贼子，你死不足辜！”绝望中的董卓固然奋力抵挡，但已无济于事，当场被杀，并诛连三族。
他先是想全数赦免董卓的部下，可继而又对群臣解释说：“本来，他们是没有罪的，只是身不由己，跟从董卓，以是不得已服从董卓调派，犯了弊端。现在如果给他们俄然加上恶逆的罪名，并且特定赦免他们，恐怕反而使他们猜忌惊骇，心机接受不了，以是，赦免他们无罪不是使他们放心的上上之策，还不如让他们接受奖惩。”
而，凉州兵是董卓的嫡派军队，战役力强，并且对董卓最忠心。董卓身后，如何措置凉州兵，是干系王允本人和东汉政权的大事。王允诡计削夺凉州兵将领的兵权，打消全数凉州兵，并且打算操纵关东兵去节制他们。但是厥后有人对王允说：“凉州兵夙来惊骇袁绍，害怕关东兵，现在，如果派关东兵去闭幕他们，凉州兵大家都会担忧性命不保，如许，很轻易引发兵变和混乱。还不如任命皇甫嵩（字义真）为将军，去担负凉州兵的统帅，并让他耐久留在那儿，以便安抚军心。”王允果断反对：“如许绝对不可，关东兵是反董卓的义兵，与我们是同一条线路，现在董卓已死，如果持续把他们屯驻在险恶之地，固然安抚了凉州兵，但是关东兵将体味狐疑我们不正视他们。”
王允与士孙瑞、杨瓒借登台拜神为名，又一次奥妙筹议拔除董卓的事件。士孙瑞说：“自从客岁年底以来，太阳不照，淫雨不竭已达六十多天，我们应当让这类倒霉国度和老百姓的期间尽快结束。现在，机会大好，我们正可趁天下沸腾之际，主动采纳办法，毁灭祸首祸首！”
李傕、郭汜追到宣平门下，叩首便拜。汉献帝壮起胆量扣问道：“你们目无国法，反叛都城，到底筹算何为么？”李傕答复说：“董太师对陛下忠心耿耿，却无缘无端遭人殛毙，我们只想替太师讨回公道，不敢造反。比及缉捕处决凶手后，我们情愿接管审判。”王允二话没说，向汉献帝行了最后的君臣大礼，便随兵士走下了城楼，李傕、郭汜号令部下当场将王允处决。
但是，吕布却今后心胸私恨，固然貂蝉已经嫁给了魏延，但是生性风骚的吕布又与董卓的婢女私通，心中非常不安。王允把诛杀董卓的打算奉告吕布，并要求他充当内应。开初，吕布分歧意，他说：“何如（我和他）如同父子一样！”王允开导说：“你姓吕，他姓董，又不是骨肉亲情。何况董卓现在是大家得而诛之的民贼，你莫非还认他作父亲吗？他向你掷刀戟的时候，把你当儿子对待吗？”不过这吕布也是生性凉薄之人，在此前更是有杀死本身寄父丁原丁建阳的前科，此时在王允的催促下，吕布终究就是顺阶而下的承诺了。