慈禧更是先一步获得动静，她当天下午即将曾国藩与李鸿章召到仪鸾殿筹议。慈禧太后坐在鸾座之上问道：“这事岂不甚奇？”曾国藩何样机灵？因为事涉本身原任的两江之地，曾国藩仓猝诚惶诚恐地答复：“这事很奇。”却不敢再说甚么。
后慈禧太后又以五百里抓紧的上谕，指派漕运总督张之万（张之洞的哥哥）“驰赴江宁，会同熬审”同时调直隶总督曾国藩接任两江总督主审此案，12月再加派刑部尚书郑敦谨以软差大臣身份驰赴江宁复审。
比来的一件也只在唐朝元和十年的时候（公元815年），丞相武元衡在早朝时为盗所害。到现在已经一千多年了，目前身边又出此事，实在让朕深为骇异。”当即下旨：江宁将军魁玉同司道各官从速严讯，务得确情，尽法惩办。
当时马新贻不过47岁，资望既浅，又无显赫军功。纯是朝廷为了制衡湘军权势培养出来的政治新贵，湘军中人，如何容得下这根“眼中钉”？
就如许几派钦差重臣，折腾了大半年，到1871年3月14日，曾国藩、郑敦谨联衔上奏，以“漏网发匪逆党挟恨复仇”具结该案，刺客张文祥被处凌迟极刑，并剖心致祭马新贻。一件大案至此，仿佛已成定验。但是，参审官员过后的各种非常表示，却令人感觉此案结犹未结，另有不能道破的隐情。
马新贻在惩办散兵游勇时非常峻厉，特别是他任命以剽悍著称的袁保庆为营务处总办，抓到为害百姓的散兵游勇即当场~正~法。散兵游勇对他恨之入骨。
郑敦谨翰林出身，前前任左都御史、刑部尚书（相称于本日的最高监察长官和司法部长），因为办案铁面忘我博得“郑彼苍”之名。
而厥后在与郑敦谨共同审案的过程中，曾国藩又常常沉默寡言，极少发问。郑敦谨停止了将近半个月的审判后，曾国藩不过是淡淡的提示郑敦谨，恐怕案子还得象之前那样奏结。曾国藩的悲观态度中有甚么样的隐情，耐人寻味。
第2、几万湘军士卒被裁撤后，此中不乏将领。这些人并不回籍务农，而是到处浪荡掳掠，有些人插手了“哥老会”（又称“袍哥”，源于四川，是近代中国活泼于长江流域，阵容和影响都很大的一个奥妙结社构造，传说中是“六合会”的分支），如许就扩大了黑权势，成为社会的一至公害。
两江总督马新贻在大街上公开被刺杀，不但是让江宁各级的处所官慌了手脚，更让某些大人物也意想不到，这件事形成的影响太严峻了。
固然曾国藩屡辞不获之下，又受了朝廷几顶夸他“老成慎重，前在江南多年，景象熟谙，措置皆宜”等高帽，不得不勉强到差，倒是一起迟延。到达江宁后，每天不过会客看书，也并不急着审案。
接着召见过马新贻，升其为两江总督，以后马便在其密旨的受权下开端了对湘军的财务调查。就在马新贻即将把承平天国财产去处弄清楚的时候，“刺马”案俄然产生。
但是这又那边是那么轻易的？别的不说他的湘军就是一个话柄，以是他对于朝廷要裁撤湘军的定见是尽力共同和支撑，但当时湘军权势强大，更有传言曾国藩有野心，因而慈僖太后先把曾国藩调离江宁。
清廷先命江宁将军魁玉会同两江“严讯”，“务将因何行刺启事及有无主使之人一一审出，据实奏闻”。魁玉等复奏：“凶犯……直认行刺不讳，而讯其行刺之由，尚属支离狡猾”。