但新发明带来的高兴就如同雷阵雨，来得快去得也快。和新宿站相连的几条铁路的运营商告诉警方，他们只会保存三礼拜的监控录相，案发当天的录相早已被删除，调查又再走进死胡同。
从墙壁取出的弹头已经严峻变形，没法停止膛线查抄。不过科搜研发明弹头曾经被改革过，刑警们由此判定犯人具有金属加工的设备和技术。加上犯案时利用的氯仿被遍及用作塑料粘合剂，搜索本部以为犯人很能够处置过金木工和手工艺方面的事情，或者存在具有相干知识的共犯。
把海量质料过滤后，搜索本部锁定一个捐献网站。这个办事器架设在美国的网站曾经在案发前募集过大量资金，但颠末用时四个月的调查，警方始终没法找到网站的运营者，也查不到那笔钱的去处，更没发明这个网站和案件有任何直接关联。
通过临海线各站的监控录相，警方肯定怀疑人乘“百合鸥号”去了新桥。刑警检视了新桥别的车站的监控录相，查出怀疑人不久掉队入jr东日本新桥站，并在车站的自助储物柜取出一个棕黄色观光包。以后刑警翻查了较早时的监控录相，发明阿谁观光包是案发前怀疑人本身放出来的。
当时遍及观点以为，怀疑人预先在车站存放行李是为了犯案后乘火车出逃。并且警方查过各个机场的记录，并没发明怀疑人的踪迹，是以更加果断本来的设法。
检视过程中，鉴识课写真阅览系的人在新宿站月台发明一个疑似身影。但这里的监控设备年代长远，录相的清楚度实在强差人意，通过科搜研对影象停止清楚化措置后，终究肯定怀疑人案发前曾经呈现在新宿。
假天花上找到的手机信号樊篱器为天朝制造，在电器商店以及购物网站有售。畴昔一年同型号的樊篱器统共售出一百零八台，但这类东西不属于管束物品，以是没要求登记采办人的身份质料。警方通过发货记录、信誉卡信息和商店的监控录相找到五十六个采办者，但最后都证明没有可疑。
比及在天下各地破钞大量人力物力却一无所获后，时候已经畴昔半年，警视厅因为各方面调查停滞不前而备受非难。搜索本部决定把调查方向转回东京都，刑警们重新检视了山手线沿途二十九个车站的监控录相，但愿能找到新线索。
在案发明场一共获得八十七组指纹，颠末遴选后证明此中二十七组属于该公司职员，别的四十八组属于停业相干人士，剩下的是大厦办理和保洁职员。因为找不到犯人指纹，搜索本部判定他犯案时戴了手套，或者在手上涂了胶水。
行凶动机调查无从动手，本来不满那家运营公司和几名被害者的人就很多，并且自从六月份的移籍事件后，事件所几近每天都收到各种百般的打单信，另有夹带刀片的信封、掰碎的cd、烧焦的生写、染血的布娃娃、被支解的人偶、乃至植物尸身等东西的恶作剧邮件更是层出不穷。
犯人一共遗留下十八件证物，包含：一张名片、一台手机信号樊篱器、八颗九毫米手枪弹的弹壳、以及不异数量的弹头。
案发后收集上一片哗然。但在遍及的怒斥声浪中，各大流派网站和留言板也不乏以为几名被害者死不足辜的幸灾乐祸谈吐，乃至对凶手的援助也不断于耳，更有功德之徒冒认行凶者招摇撞骗。