昱奉令出宫，颁示百官，当即迎奕入殿，缵承帝祚，颁诏大赦，奉葬哀帝于安平陵。哀帝崩时才二十五岁，在位只阅四年。晋廷丧君立君，方繁忙的了不得，那燕兵竟趁机打击洛阳，遂使懦夫丧躯，园陵再陷，河洛一带，复为强虏统统了。言之慨然。
惟燕兵复屡寇晋境，燕抚军将军慕容厉寇兖州，连陷鲁高平数郡。晋南阳督护赵亿，举宛城降燕。燕令南中郎将赵盘戍宛。越年初夏，燕镇南将军慕容尘，又寇晋竟陵，幸亏晋太守罗崇，应变有方，出兵击退燕军，又与荆州刺史桓豁，合兵攻宛，走赵亿，逐赵盘，夺还宛城，崇还戍竟陵。豁追赵盘至雉城，复杀败盘兵，且将盘活擒返来，燕人始稍稍夺气，敛兵自固。并且燕室长城慕容恪，抱病垂死，不能视事，以是境外军务，暂从搁置，不复进兵。
那陈祐自洛阳解缆，并未往许，竟奔趋新城。晋廷得报，即由会稽王昱，亲赴赭圻，与大司马桓温议御燕事。温乃移镇姑孰，表荐右将军桓豁监督荆州扬州的义城，及雍州的京兆诸军事，振威将军桓冲，监督江州荆州的江夏的随郡，及豫州的汝南西阳新蔡颍川诸郡军事。豁与冲俱系温弟，温虽是举不避亲，究竟有阴布羽翼，广拓声望的意义。直诛其心。会闻哀帝大渐，会稽王昱仓促返都，及抵建康，哀帝已经升遐了。昱入见太后，与议嗣位事件。哀帝无子，只好令哀帝弟奕，入承大统，当由太后褚氏命令道：
帝遂不救厥疾，艰祸仍臻，遗绪泯然，哀恸切心。琅琊王奕，明德茂亲，属当储嗣，宜奉祖宗，纂承大统，俾速正大礼以宁人神，特此令知。
越年，哀帝寝疾，复请褚太后临朝摄政，拜温为扬州牧，使侍中颜旄，宣温入朝参政。温上表固辞，朝旨不准，再发使征温。温乃启行至赭圻，不料来了尚书车灌，止温入都，不过说是“秦燕内侵，仍须赖公外镇”如此。想是虑他权重难制，故使中断。温不肯即还，便在赭圻筑城，临时驻节，遥领扬州牧。那哀帝因科学方士，好饵金石，乃至毒性沈痼，生就一种慢性症，一时不至遽死，亦不能复愈。拖延过了一年，已是兴宁三年了，皇后王氏，却得了暴病，骤致不起，因即棺殓治丧，追谥曰靖。上元令节，变作哀期，适燕太宰慕容恪，复拟取晋洛阳，先遣镇南将军慕容尘，攻陷许昌汝南诸郡，然后使司马悦希驻盟津，豫州刺史孙兴驻成皋，垂垂的进逼洛水。洛阳守将陈祐，检阅部兵，不过二千，粮饷又不过数月，自知不能恪守，不如引众先走，遂借援许为名，出城径去，但留长史沈劲守洛阳。劲系王敦参军沈充子，充受诛后，劲窜匿乡里，年三十余，不得入仕。吴兴太守王胡之，受调为司州刺史，特请免劲监禁，起为参军。有诏依议。偏胡之忽婴疾病，未得莅镇。劲独上书自请，愿至洛阳效力。晋廷乃命劲为冠军长史，使自募兵士，赴洛参军。劲募得懦夫千人，入洛助祐，前此得却燕围，劲力居多，至祐出城自行，将士多由祐带去，只剩下五百人，随劲留守。劲明知孤危，却反欣然道：“我志在致命，今可偿我初志了。”遂率五百人誓死守城。