1990－92：季后赛首轮恶梦马刺队证了然他们在1989－90赛季的表示不是个不测，他们在接下来的赛季中力压犹他爵士队，持续第二年获得中西部分区的冠军。球队获得55胜27负的好成绩。
季后赛首轮，马刺在同菲尼克斯的比赛中连下三城淘汰敌手。在第二轮中，马刺队和犹他爵士队大战六场，但同94年的成果如出一辙，马刺队再次被对方淘汰。
季后赛中，马刺队在第一轮横扫了丹佛掘金队，4比2击败了洛杉矶湖人队，然后在与休斯敦火箭队停止了6场西部决赛后败下阵来。
全部1996－97赛季的痛苦经历在5月18日一散而空，在那一天马刺队博得了1997年nba选秀的头号选秀权。这给了他们挑选来自维克丛林大学的具有统治力的明星邓肯的权力。在具有了由罗宾逊和邓肯构成的强大的前场组合后，圣安东尼奥希冀他们能在1997－98赛季中再一次回到冠军争夺者的行列中去。
约翰-卢卡斯随后被授予主锻练的职责。马刺队在这名前nba后卫的带领下打出了灵气实足的比赛，在他接办后的18场比赛中赢下了此中的16场。球队一个首要的窜改是在先发阵容中增加了5尺10寸的控球后卫埃弗里-约翰逊（averyjohnson）。作为卢卡斯锻练之前在西雅图时的队友，“a.j.”在他为马刺打先发的前12场比赛中均匀每场获得11.4分和9.9次助攻，并帮忙球队获得11胜1负。
这个赛季的残局并不睬想。在罗德曼禁赛的环境下，圣安东尼奥跌跌撞撞地获得了7胜9负的成绩。但马刺队在厥后的比赛中打出了55胜11负，此中包含了2次的15连胜。他们在通例赛的最后23场比赛中获得了21胜2负。球队在2、3、4月份别离获得了11胜2负、14胜2负和11胜2负，并随之获得中西部分区的冠军。
季后赛第二轮对阵太阳，马刺让菲尼克斯人惊出了一身盗汗。太阳队在菲尼克斯的第五场比赛中以109比96击败了马刺。第六场比赛是在马刺主场半球球馆（别名赫米斯集市球馆）停止的。在100平以后，太阳大前锋查尔斯-巴克利（charlesbarkley）在比赛还剩下1.8秒时射中了18尺外的跳投，以后大卫-罗宾逊未能射中20尺外的压哨跳投，马刺队被淘汰出局。这也是在半球球馆停止的最后一场比赛。马刺队在1993－94赛季搬到了极新的阿拉莫球馆（alamodome）。
主锻练鲍勃-希尔在3胜15负的残局后引咎辞职，而代替他的原总经理格雷格-*维奇（greggpopovich）在他担负nba主锻练的第一个赛季中仅仅获得了17胜47负的成绩。
在和底特律活塞队停止的买卖中，马刺用选秀获得的比尔-柯利换来了旧将肖恩-埃利奥特，而他也为马刺的打击作出了庞大的进献，场均获得18.1分并且脱手三分333次，射中136个，40.8%的三分射中率在nba排名18。罗德曼表面看上去还是独一无二，而他的篮板才气也仍然无人能及。固然错过了33场比赛，他还是持续第四年拿下篮板王（16.8个）并且当选nba第三阵容以及nba戍守第一阵容。