得知武眠风已死的动静后，黄药师叮咛梅超风寻觅《九阴真经》，并带其他弟子及家眷到归云庄。在寻觅的过程中，梅超风对黄药师的虔诚和敬爱更甚以往。
别的，另有田七鲨胆散等其他药物。
在烟雨楼大战中，黄药师服从女儿黄蓉的要求，卖力庇护江南七怪中独一幸存的柯镇恶，即便柯镇恶欺侮他，他也毫不在乎。这场大战后，黄药师护送洪七公回桃花岛养伤。一年后，洪七公伤势病愈，黄药师和洪七公便前后离岛，前去华山参与华山论剑。
倪匡对黄药师的描述：黄药师是上中人物，他萧洒不羁，视天下为无物。他不喜傻小子郭靖，这是能够了解的。本来，黄药师可算是绝顶人物，但他因迁怒于铜尸铁尸偷了九阴真经，而与其他弟子何干？何况真的如此超绝，又何必如此正视九阴真经？莫非无所不能的黄老邪，就非得依托九阴真经不成？他本身不会去创出比九阴真经更高的武功来吗？至于要在爱妻坟前焚化九阴真经，那只是固执的造作，不是至情至性的表示。是以，他连上上人物都算不上，只是上中人物。
黄药师是金庸武侠小说《射雕豪杰传》和《神雕侠侣》中的角色。他是天下“五绝”之一，外号“东邪”，是黄蓉的父亲，对其妻冯氏一往情深。
黄药师的两个门徒陈玄风、梅超风相互倾慕，但黄药师脾气怪癖，不肯应允，他们决定盗取了师父的《九阴真经》下卷以后逃脱。黄药师得知后，挑断了其他四个门徒的腿筋，全数逐出师门。
附骨针：伸手在人身上悄悄一拍，那针便深切肉里，紧紧钉在骨骼的枢纽当中。针上喂有毒药，药性倒是渐渐发作，每日六次，按着血脉运转，叫人遍尝诸般难以言传的狠恶苦痛，一时又不得死，要折磨到一两年火线取人道命。
他的浪漫，并非少年期间的梦幻般的浪漫，而是一名深谙爱欲的成熟男人的浪漫。他正视真情，平生都在追随和思念，不计得失。当看到黄蓉深爱郭靖，难舍难分时，他感同身受，悲从中来。
他本性离经叛道，狂傲不羁。脾气孤介，护短，行事奇特却不失萧洒。身形飘忽，有如鬼怪。黄药师冷视“传统礼教”，但最恭敬忠臣孝子。
在原著中，《九阴真经》本来是黄药师“赖以成艺”的武学奇书，自第二版开端已经编削。第二版中的“落英神剑掌”，在第三版中称为“桃华落英掌”。在新版的《射雕豪杰传》中，插手了黄药师与徒儿的各种新干系。
落英神剑掌是一种从剑法中窜改而来的掌法，其招式包含“江城飞花”、“雨急风狂”和“散花势”。此掌法如落英缤纷，如万花齐落，妙在姿势超脱，仿佛翩翩起舞，而掌凌厉如剑。落英神剑掌能够和兰花拂穴手、旋风扫叶腿并用，能力更增。
在江南的陆家庄，黄药师应用他那强大的“弹指神通”轻松地压抑了被称为“赤练仙子”的李莫愁，以绝对的力量破解了她那可骇的“冰魄银针”，同时胜利救走了程英，将她收为弟子。
多年以后，周伯通发明黄蓉是他的侄女，便开端向她送酒和食品。黄蓉因为不满父亲的叱骂而离家出走，因而周伯通便常常给她送食品。黄蓉在北上的路上碰到了洪七公，两人一起行侠仗义，终究回到了桃花岛。