在打击宇和的同时，另一支元兵舰队驶入土佐湾，元军登岸后霸占高知城，然后与从宇和前来的元军会师，扫荡日军，七今后，元军胜利占据四国岛全境。
北条时宗率残兵退入京都，据城戍守。在击溃日军以后，元军并没有急于攻城，而是追击崩溃的日本军人，将其尽数斩杀，一时候京都城下尸如山积，登城了望敌情的北条时宗见状，惊怒交集，口喷鲜血，晕厥畴昔，后为天皇派来的太医救醒。
此光阴甲士数固然大大超越元军，但是如何批示这些平时互不统属的军人们协同作战，成了摆在镰仓幕府面前的一道困难。而元军没有给幕府处理困难的时候。
仰仗与元军对峙的契机，镰仓幕府再次强化了本身的权力。十仲春八日，幕府号令各国本来上贡朝廷的国衙领和本所一元领出产的米粮充当战役军需，起初公布的关于寺社本所一元地尽忠朝廷的官兵必须在武家的批示下参与抗元战役的号令也被朝廷所正式承认。如许一来，本来由朝廷任命的国司所把握的抗战权力完整为武家政权所代替，朝廷独一能够做的就只剩下在诸国的神社、国分寺停止敌国降伏的祷告。武家幕府的权力自此超出了公家朝廷，成为日本列岛的独一统治者。
十一月，元军颠末修整后，在九州本地征收足了行军用的粮草，又从高丽来的船队弥补了弹药，统统筹办结束，于二旬日乘船解缆，打击四国岛。
完整毁灭城外日军以后，元军开端攻城，和以往分歧的是，元军此次没有强行架设云梯爬城，而是集合火炮轰击城池。城墙上的日本人目瞪口呆的发明，元军的阵列当中架起了一门庞大的火炮。
元军进入大阪后，忻都兑现了信誉，对城内住民秋毫无犯，征集粮秣物质也都“尽给其值”，被称为“佛兵”。不甘心投降的一些日本军人对元军建议他杀式的进犯，多数被杀，大阪城守草井友长及其部下三十二人败北后退入梵刹内，切腹他杀。
大阪陷掉队，日本军人们纷繁云集京都，插手到城戍守军当中，连续到来的日本军人加上本来的京都守军，人数很快超越了十万人。执权北条时宗也亲身到京都批示防备，并刺血明誓，要在京都全歼元军。