此时佐助以为本身已经获得了超出大蛇丸的力量而俄然向大蛇丸发难，破解了他的转生忍术，打倒了大蛇丸。佐助找到了大蛇丸本来的部下水月、香磷和重吾，四人构成名为“蛇”的小队，为了寻觅鼬而展开行动。在此期间，佐助与“晓”的迪达拉遭受并交兵，迪达拉败于佐助部下，为了证明本身的艺术而自爆，佐助却躲在了万蛇的体内而躲过一劫。迪达拉
鸣报酬了学得比螺旋丸更强的术而展开修行，此时“晓”的成员飞段和角都为了捕获九尾而入侵木叶，与第十班的成员交兵，阿斯玛在这一战中中了飞段的咒术而捐躯。为了替阿斯玛报仇，鹿丸等人结成新的小队，与卡卡西一道向飞段和角都应战。鹿丸应用过人的聪明打败了劲敌飞段，而鸣人也终究学成了新术“风遁・螺旋手里剑”，来到疆场援助，一击打倒了角都，赢得胜利。
在忍者黉舍是万年吊车尾的鸣人，终究获得伊鲁卡教员的认同而顺利毕业，并和同期毕业的佐助、小樱分派到同一小组。指导上忍卡卡西为了培养鸣人他们的团队合作精力而在保存练习中设下各种磨练，终究鉴定他们合格，也使得鸣人他们学习到了团队合作的首要性。
们遭到原属木叶忍者村、已经叛离村庄的大蛇丸的进犯，佐助也被大蛇丸在身上留下了咒印。以后，鸣人和佐助顺利通过预选赛，并为即将到来的正式测验作筹办。鸣人获得木叶三忍之一的自来也传授忍术，而佐助则是遭到卡卡西的专门指导。但与此同时，大蛇丸正在公开里酝酿着诡计，那就是结合砂忍者村一同攻击木叶。
在外修行了两年半的鸣人返来了。但此时的“晓”也开端蠢蠢欲动，已经成为砂忍者村风影的我爱罗被“晓”成员迪达拉和蝎掳走。鸣人和卡卡西小组为了救出我爱罗而前去砂忍者村，并找出了“晓”的按照地，但我爱罗已经被抽离尾兽而灭亡。气愤的鸣人不顾统统地追逐迪达拉，而小樱和砂忍者村的千代婆婆联手与蝎交兵，终究将蝎打倒。千代婆婆捐躯本身的生命，利用转生忍术将我爱罗重生，鸣人他们回到木叶忍者村。
大蛇丸找到纲手，但愿她能医治本身的双手，并提出能够让她再次见到她最正视的两人的前提。纲手为此踌躇不决，这时鸣人和自来也找到了她。纲手对继任火影一事心灰意冷，但她看到鸣报酬了成为火影的胡想而刻苦修行的模样，也逐步窜改了设法。以后纲手回绝了大蛇丸的要求，昔日的三忍展开狠恶的战役，鸣人也终究练成了自来也所传授的螺旋丸，打败了大蛇丸的侍从兜。最后大蛇丸被逼退，纲手跟从自来也和鸣人回到木叶，成为第五代火影。
鸣人在正式测验的第一场击败了人称天赋的日向宁次，向大师证了然本身的气力。但在测验半途，音忍和砂忍们开端向木叶忍者村策动进犯，测验也被迫中断。大蛇丸向第三代火影建议应战，在一场苦战过后，第三代火影战死，而大蛇丸也支出了落空两只手臂的代价，被迫撤退。鸣人则与砂忍者村派来的“兵器”我爱罗比武，并打败了我爱罗。
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在外修行了两年半的鸣人返来了。但此时的“晓”也开端蠢蠢欲动，已经成为砂忍者村风影的我爱罗被“晓”成员迪达拉和蝎掳走。鸣人和卡卡西小组为了救出我爱罗而前去砂忍者村，并找出了“晓”的按照地，但我爱罗已经被抽离尾兽而灭亡。气愤的鸣人不顾统统地追逐迪达拉，而小樱和砂忍者村的千代婆婆联手与蝎交兵，终究将蝎打倒。千代婆婆捐躯本身的生命，利用转生忍术将我爱罗重生，鸣人他们回到木叶忍者村。