疾风传
卡卡西因为劳累过分而住院，暗部的大和代替卡卡西带领卡卡西小组，新的成员佐井也插手了步队。他们操纵从蝎那边获得的谍报，前去六合桥探听有关佐助的动静。但佐井实际上倒是奉下属团藏的号令履行暗害佐助的极秘任务，本筹算履行任务的他在看到鸣人与佐助的拘束以后窜改了设法。鸣人等人终究在大蛇丸的按照地与佐助相逢，但佐助仍然不筹算转意转意，还是挑选和大蛇丸一起分开。而佐井则因为这一任务的契机成为了鸣人他们的火伴。
们遭到原属木叶忍者村、已经叛离村庄的大蛇丸的进犯，佐助也被大蛇丸在身上留下了咒印。以后，鸣人和佐助顺利通过预选赛，并为即将到来的正式测验作筹办。鸣人获得木叶三忍之一的自来也传授忍术，而佐助则是遭到卡卡西的专门指导。但与此同时，大蛇丸正在公开里酝酿着诡计，那就是结合砂忍者村一同攻击木叶。
鸣人他们完成任务回到村庄，卡卡西保举他们插手即将停止的中忍测验。测验会场中强手云集，而在测验过程中，鸣人他们遭到原属木叶忍者村、已经叛离村庄的大蛇丸的进犯，佐助也被大蛇丸在身上留下了咒印。以后，鸣人和佐助顺利通过预选赛，并为即将到来的正式测验作筹办。鸣人获得木叶三忍之一的自来也传授忍术，而佐助则是遭到卡卡西的专门指导。但与此同时，大蛇丸正在公开里酝酿着诡计，那就是结合砂忍者村一同攻击木叶。
大蛇丸找到纲手，但愿她能医治本身的双手，并提出能够让她再次见到她最正视的两人的前提。纲手为此踌躇不决，这时鸣人和自来也找到了她。纲手对继任火影一事心灰意冷，但她看到鸣报酬了成为火影的胡想而刻苦修行的模样，也逐步窜改了设法。以后纲手回绝了大蛇丸的要求，昔日的三忍展开狠恶的战役，鸣人也终究练成了自来也所传授的螺旋丸，打败了大蛇丸的侍从兜。最后大蛇丸被逼退，纲手跟从自来也和鸣人回到木叶，成为第五代火影。
鸣报酬了学得比螺旋丸更强的术而展开修行，此时“晓”的成员飞段和角都为了捕获九尾而入侵木叶，与第十班的成员交兵，阿斯玛在这一战中中了飞段的咒术而捐躯。为了替阿斯玛报仇，鹿丸等人结成新的小队，与卡卡西一道向飞段和角都应战。鹿丸应用过人的聪明打败了劲敌飞段，而鸣人也终究学成了新术“风遁・螺旋手里剑”，来到疆场援助，一击打倒了角都，赢得胜利。
此时佐助以为本身已经获得了超出大蛇丸的力量而俄然向大蛇丸发难，破解了他的转生忍术，打倒了大蛇丸。佐助找到了大蛇丸本来的部下水月、香磷和重吾，四人构成名为“蛇”的小队，为了寻觅鼬而展开行动。在此期间，佐助与“晓”的迪达拉遭受并交兵，迪达拉败于佐助部下，为了证明本身的艺术而自爆，佐助却躲在了万蛇的体内而躲过一劫。迪达拉
在忍者黉舍是万年吊车尾的鸣人，终究获得伊鲁卡教员的认同而顺利毕业，并和同期毕业的佐助、小樱分派到同一小组。指导上忍卡卡西为了培养鸣人他们的团队合作精力而在保存练习中设下各种磨练，终究鉴定他们合格，也使得鸣人他们学习到了团队合作的首要性。