东海恭王强病，上遣使者太医乘驿视疾，骆驿不断。诏沛王辅、济南王康、淮阳王延诣鲁省疾。戊寅，强薨，临终，上疏谢恩，言：“身既夭命，孤弱复为皇太后、陛下忧愁，诚悲诚惭！息政，小人也，猥当袭臣后，必非以是全利之也，愿还东海郡。今天下新罹大忧，惟陛下加扶养皇太后，数进御餐。臣强困劣，言不能尽意，愿并谢诸王，不料永不复相见也！”帝览书悲哀，从太后出幸津门亭发哀，使大司空持节护丧事，赠送以殊礼，诏楚王英、赵王栩、北海王兴及京师亲戚皆会葬。帝追惟强深执谦俭，不欲厚葬以违其意，因而特诏：“遗送之物，务从约省，衣足敛形，茅车瓦器，物减于制，以彰王卓尔独行之志。”将作大匠留起陵庙。
秋，八月，戊辰，诏改太乐官曰太予，用谶文也。
莎车王贤以兵威胁夺于竗、大宛、妫塞王国，使其将守之。于竗人杀其将君德，立大人休莫霸为王。贤率诸国兵数万击之，大为休莫霸所败，脱身走还。休莫霸进围莎车，中流矢死，于竗人复立其兄子广德为王，广德使其弟仁攻贤。广德父先拘在莎车，贤乃归其父，以女妻之，与之和亲。
永平二年己未，公元五九年春，正月，辛未，宗祀光琥天子于明堂，帝及公卿列侯，始服冠冕、玉佩以行事。礼毕，登灵台，望云物。赦天下。
秋，七月，马武等击烧当羌，大破之，馀皆降散。
丙辰，以左冯翊郭丹为司徒。
甲子，立朱紫马氏为皇后，皇子炟为太子。后，援之女也，光武时，以选入太子宫，能阿谀阴后，傍接同列，礼则修备，高低安之，遂见宠异；及帝即位，为朱紫。时后前母姊女贾氏亦以选入，生皇子炟。帝今后无子，命养之，谓曰：“人一定当自生子，但患爱养不至耳！”后因而经心抚养，劳悴过于所生。太子亦孝性淳笃，母子慈爱，始终无纤介之间。后常以皇嗣未广，荐达摆布，若恐不及。后宫有进见者，每加慰纳；若数所宠引，辄加隆遇。及有司奏立长秋宫，帝未有所言，皇太后曰：“马朱紫德冠后宫，即其人也。”后既正位宫闱，愈自谦肃，好读书。常衣大练，裙不加缘；朔望诸姬主朝请，瞥见后袍衣疏粗，觉得绮縠，就视，乃笑。后曰：“此缯特宜染色，故用之耳。”群臣奏事有难平者，帝数以试后，后辄分化趣理，各得其情，然何尝以家私干政事。帝由是宠敬，始终无衰焉。
永平元年戊午，公元五八年春，正月，帝率公卿已下朝于原陵，如元会仪。乘舆拜神坐，退，坐东厢；侍卫官皆在神坐后，太官上食，太常吹打；郡国上计吏以次前，当神轩占其郡谷价及民所痛苦。是后遂觉得常。
夏，四月，辛酉，封皇子建为千乘王，羡为广平王。
东平王苍觉得复兴三十馀年，四方无虞，宜修礼乐，乃与公卿共议定南北郊冠冕、车服轨制及光武庙登歌、八俏舞数，上之。